茎は不規則に枝を分岐し、葉をやや離れてつける。茎葉と枝葉はよく似ている。葉は長さ1〜1.6mmの卵形〜広卵形で、中肋は葉先に達せず、中肋の背面上端に歯がある。葉縁に舷はなく、細かい歯が全周にある。葉身細胞は長さ30〜40μmの長六角形〜線形。�凾ﾍ非相称で、傾き、気孔をもつ。�剳ｿにはパピラがある。蓋には長い嘴がある。�剿Xは僧帽形。
　ツクシナギゴケは枝が密につき、葉の基部がやや広く下延する心臓状卵形。