茎は4稜形で、下向きの毛が生える。葉は対生し、長さ3〜10pの長楕円形〜披針形で、葉の基部はなだらかに細くなり、翼のついた葉柄に続く。葉表に軟毛が生え、中央脈には両面ともに曲がった毛が生える。葉裏には腺点がある。花柄は紫褐色を帯び、開出毛が密生する。花は総状花序につき、花冠は青紫色、長さ8〜9oで、上唇は4裂し、班紋はなく、短毛がある。下唇の縁が内巻きになって突き出す。雄しべ、雌しべとも花冠より短くて見えない。萼は紫褐色を帯び、同長に5裂し、短毛が密生する。
ヤマハッカは葉の幅が広く、基部は急に細くなり、花冠に濃紫色の班点がある。