茎は四稜形で、稜上に下向きの刺毛が生える。葉は対生し、長さ3〜9p、幅1〜2.5pの三角状披針形で、表面にシワがあり、縁に低い鋸歯があり、基部は切形。葉裏の脈上に短い刺毛がある。茎の上部の葉には葉柄がないが、中部以下の葉に長さ1〜2pの葉柄がある。茎頂に数段の仮輪の花序をつける。花冠は長さ12〜15oの淡紅色の唇形で、上唇は裂けず先が丸く、下唇は3裂して紅紫色の斑紋がある。雄しべ4個と雌しべ1個は上唇に沿う。萼は緑色〜赤褐色で、5裂し、先が刺状に尖る。果実は4分果、分果は長さ1.7〜2o。
エゾイヌゴマは茎、葉、萼に粗い剛毛が生える。九州や沖縄に多いケナシイヌゴマは無毛。