茎の断面は四角形で、わずかに毛が生える。葉は長さ0.7〜1.4�p、幅3〜5�oで、普通4個輪生し、先がとがらない。ヤエムグラ属の花冠は4裂するのが普通だが、ホソバノヨツバムグラだけ3裂である。花冠が4裂の類似種はヒメヨツバムグラとヨツバムグラで、ヒメヨツバムグラは葉先が細くとがり、ヨツバムグラは葉全体が丸味を帯びていることで区別できる。