全体に緑色。茎は基部で分かれ、叢生する。葉は長さ10〜20�p、幅0.5〜1.8�pの線形で、無毛。葉鞘も無毛。葉舌は毛状。花序は長さ3〜7�p、幅約8�oの円柱形で、ほぼ直立する。小穂は長さ約2�o。第1苞頴は長さ約0.8mm、第2苞頴は長さ約2mmで小穂と同長。小穂の基部に長さ8〜12mmの緑色の剛毛（刺毛ともいわれる。）（=総苞毛）がある。総苞毛には上向きの刺がある。総苞毛に下向きの刺があるものはザラツキエノコログサといい、総苞毛が中間で強く屈曲するものはイヌエノコログサという。果実は長さ約1.2mmの卵形、乳白色。
　アキノエノコログサは穂が大きく、小穂も約3mmと大きい。エノコログサの海岸型の変種であるハマエノコロは穂の毛が密で長く、花序の長さが短い。