浮葉・沈水植物で、水中の葉は線形、水上葉は倒卵形〜倒披針形。雌雄同株。花は花弁や萼がなく、雄花は雄しべ１個、雌花は雌しべ１個で花柱2個が直立する。果実は長さ約1mmのやや縦長で、綾の上部に狭い翼がある。帰化種のイケノミズハコベはよく似ており、果実がほぼ円形で、稜の翼が全周につき、花柱が曲がる。