開発による湿地、湿潤地の減少により、全国的に絶滅寸前であり、絶滅危惧種に指定されている。
根茎はなく、茎は無毛で、平滑、叢生する。葉は柔らかく、無毛。葉舌は長さ2.5〜3mm、白色、膜質。葉鞘は無毛。円錐花序にまばらに小穂をつける。花序の枝は開出する。小穂は外来種の道端や畦道などに生育するコヌカグサ(レッドトップ)と同様に、淡緑色〜淡紫色を帯び、長さ2.5〜3mm、無芒。小花は1個。苞穎は護穎よりわずかに短く、第2苞穎は第1苞穎より幅が広い。小花が苞頴よりやや大きいのが特徴である。護頴は薄膜質、3脈がある。内穎は微小。
コヌカグサはヒメコヌカグサより小穂がやや密につき、花序枝の基部近くまで小穂がつく。また、内頴は護穎の半長より長く、匍匐根茎がある。
ヌカボは花序の枝が開出しない。
ヌカキビは小穂がまばらにつくが、枝から垂れ下がる。