日本に生育するミゾハギ属はミソハギとエゾミソハギの2種である。どちらも、よく栽培されており、自生は少ないものと思われる。エゾミソハギは茎、葉、萼など全体に短毛が生える。葉は対生し、基部は茎を抱く。萼片の付属片が直立する。
　ミソハギは全体に無毛で、葉の基部は茎を抱かず、萼片の付属体が開出する。